5 марта 1991 года было образовано Республиканское управление науки, народного образования, культуры и религии
Министерству просвещения ПМР сегодня исполняется 23 года. 5 марта 1991 года Верховным Советом Приднестровской Молдавской Советской Социалистической Республики было принято Постановление № 27 о создании Республиканского управления науки, народного образования, культуры и религии, ставшего прообразом нынешнего Минпроса ПМР.
8 сентября 1992 года Верховным Советом ПМР принимается решение о формировании на базе Республиканского управления Министерства науки, народного образования, культуры и культов.
28 апреля 1995 года изменяется структура органа исполнительной власти и создаётся Министерство народного образования.
5 февраля 1997 года Постановлением Верховного Совета ПМР в сферу руководства Министерства народного образования попадает и наука, и, соответственно, этот орган стал называться Министерством народного образования и науки. 28 мая 1997 года было возвращено прежнее наименование без изменения функций - Министерство народного образования. 25 июля 2000 года Указом Президента ПМР принимается решение о слиянии управленческих структур науки, образования, культуры, спорта и молодёжной политики в единый государственный исполнительный орган - Министерство просвещения ПМР.
В 2013-2014 годах из состава Минпроса ПМР были выделены госслужбы, курирующие вопросы культуры и спорта.